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run_julia_notebook_from_ccad_using_VSCode.md

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run_julia_notebook_from_ccad_using_VSCode.md

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Run notebook from CCA using VSCode

Primero debemos hacer uso de las herramientas que nos provee OpenSSH para configurar las diferentes conecciones mediante SSH (todo esto funcionará siempre que usemos sistemas operativos Linux o macOS).

En general, el directorio ~/.ssh/ se crea automáticamente cuando corremos el comando ssh por primera vez. Aunque, si el directorio no existe en el sistema podemos crearlo mediante el comando:

    @prompt$: mkdir -p ~/.ssh && chmod 700 ~/.ssh

Por default, el archivo de configuración ssh no existe por ello debemo crearlo de la siguiente manera

    @prompt$ touch ~/.ssh/config
    @prompt$ chmod 600 ~/.ssh/config

donde le hemos dado permisos de lectura/escritura solamente al usuario.

Luego, en el archivo creado debemos agregar la siguiente línea:

    Host jupyterCCAD
        HostName  jupyter.ccad.unc.edu.ar
        User username

For more information check: https://linuxize.com/post/using-the-ssh-config-file/

La configuración anterior nos permite prescindir del script .bash_aliases y poder loguearnos al servidor de jupyter de CCAD corriendo el comando @prompt$ ssh jupyterCCAD

Ahora bien, debemos abrir VSCode (consultar aquí en caso de no tenerlo instalado) e instalar ((Ctrl+Shift+X)) las extenciones Remote - SSH. Luego abriendo la paleta de comandos (Ctrl+Shift+P) buscamos la opción Remote-SSH: Connect to Host... y seleccionamos el host jupyterCCAD que debería aparecernos en la lista desplegable.

Luego de esto, se nos abrirá una nueva sesión de VSCode y ya estaremos dentro del nodo de jupyter de CCAD para poder abrir cualquier archivo.

Para poder correr un notebook previamente creado debemos intalar (Ctrl+Shift+X) en SSH:jupyterCCAD las extensiones Jupyter y Julia. Luego de esto al abrir un notebook de Julia VSCode detectará automáticamente el kernel de julia (siempre que hayamos instalado julia dentro del nodo jupyterCCAD).

Configure the Jupyter kernel

Para poder hacer visible el kernel de Julia para Jupyter es necesario instalar el paquete IJulia. Para ello, debemos abrir julia y ejecutar los siguientes comandos:

    julia> using Pkg
    julia> Pkg.add("IJulia")

Luego de esto, al abrir un notebook de Julia en VSCode deberíamos poder seleccionar el kernel de Julia en la parte superior derecha del notebook.